指導水利設施的管理、保護和綜合利用，組織編制水庫運行調度規程，指導水庫、堤防、水閘等水利工程的運行管理與劃界工作。組織指導水庫大壩、水閘等水利工程的安全鑒定和安全管理工作。組織指導水利工程管理標準化工作。組織編制洪水干旱防治規劃和防護標準、重要河道、水庫和重要水工程的防御洪水抗御旱災調度以及應急水量調度方案并組織實施。協調水情旱情預警工作。組織協調指導蓄滯洪區安全建設、管理和運用補償工作，協助洪泛區、蓄滯洪區、防洪保護區的洪水影響評價工作。協調落實東調工程有關重大政策和措施。指導監督東調工程運行管理工作。組織開展東調后續工程前期和建設管理工作。督促指導地方配套工程建設。